Los planteles de divisiones inferiores del Tricolor se midió con los santotomesinos, cosechando 3 victorias, 2 empates y 4 derrotas.
En el marco de las Inferiores Mayores, la 5ta división de El Pozo cayó por 2 a 0, la 2009 ganó 2 a 0 con goles de Juan Martín Sánchez y Santiago Ramírez, mientras que en 2010 fue derrota por 2 a 0.
En las categorías menores, el Tricolor e Independiente dividieron puntos, tras la victoria de El Pozo en 2011 por 1 a 0 con tanto de Uziel Montero, la igualdad sin goles en 2012 y la derrota 2 a 1 de la 2013 que llegó al gol por intermedio de Máximo Coronel.
Por último en Infantiles, en 2014 igualaron 1 a 1 con gol de Benicio Gil Morel para El Pozo, la 2015 cayó 1 a 0 y la categoría 2016 ganó por 3 a 0 con tantos de Blas Niklison, Gonzalo Santa Cruz, Maximiliano Alarcón.